Parallel School Days教室有不同的色调。缺乏自信、在学校里不起眼的女高中生志乃莉，有一个交往了半年的男朋友。对方是所有人都憧憬的班级里的中心人物水崎。本以为不会往来，没想到会成为恋人的志乃莉，看起来过着充实的生活。但是，她有一个无法告诉任何人的秘密。某日发生的某件事，让志乃莉走进了一个不可思议的世界。土气不起眼的自己，变成了班级里的红人。而原本是班级中心人物的那个人，却到了班级的角落里。班级的阶级制度逆转了，成为了另一个2年B班。在另一个世界里，教室、同学与往常存在着什么差异。志乃莉能走出这个世界吗？...